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ibms.sinica.edu生物醫學科學研究所（簡稱生醫所）的籌備工作始于1981年2月，當時由余南庚院士擔任籌備委員會主任及籌備處主任。隨後，錢煦院士於1987年接任籌備處主任，並帶領超過二十位研究人員正式啟動研究工作。到了1988年，吳成文院士接替成為籌備處主任，並在1993年12月1日生醫所正式成立後出任首任所長。之後，伍焜玉院士（任期從1997年1月至1999年12月）、陳垣崇院士（任期從2001年7月至2010年6月）以及劉扶東院士（任期從2010年7月至2017年9月）先後接任所長職務。自2017年10月起，郭沛恩特聘研究員開始擔任第五任所長。

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