ATCC细胞鉴定即通过短串联重复图谱所建立细胞系的遗传特征。一株细胞系的遗传特征确立后，细胞系可以通过定期的检测，以防止出现细胞系被误认或交叉污染的情况。进行细胞系短串联重复鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行，这些细胞可能是受赠于其它研究人员，也可能是从细胞库(如ATCC)得来。据估计，15-20%的实验室，实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系，或者与其它细胞系发生了交叉污染。显然，细胞系遭到污染、特征鉴别错误，将会大大的威胁着基于这些细胞而发表的论文质量和研究发现的正确性。为此，很多细胞库现在都要对提交来的细胞系进行鉴定，并对细胞系之间的交叉污染进行监测。

　　很多机构都已经认识到这个的重要性，ATCC和FDA这些机构要求对用于制药领域的实验中所使用的材料-诸如细胞系-应该进行“身份鉴定”和纯度测试。很多杂志也要求使用细胞系的文章提供短串联重复指纹图谱数据。

　　若实验室使用不止一种细胞系，则应在实验开始时，就要对所有的细胞系进行鉴定，以便排除交叉污染。这样将减少由于细胞系发生交叉污染或身份误认，将导致实验数据的无效或数据误导。